Генотипирование гепатита С (РНК)

Краткая информация:
Лабораторное исследование генетического материала РНК вируса гепатита С и
определение генотипа проводится для прогнозирования заболевания и подбора наиболее
эффективного лечения. Тестирование проводится с помощью полимеразной цепной
реакции сыворотки крови пациента.
Основная информация:
Вирус гепатита С (ВГС) является важным патогеном человека с высокой частотой
хронизации. По оценкам, 71 миллион человек во всем мире живут с хроническим
гепатитом С, что является риском прогрессирования заболевания до фиброза печени,
цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы. Подобно другим РНК-вирусам, вирус гепатита
С обладает высокой степенью генетической изменчивости, обусловленной высокой
частотой мутаций и действием эволюционных сил с течением времени.
Существует два уровня генетической изменчивости HCV: внутривенная изменчивость,
характеризующаяся распределением мутантных геномов HCV, присутствующих у
инфицированного индивида, и внутривидовая изменчивость, представленная глобально
циркулирующими вирусами, которые дают начало различным генотипам и подтипам
вируса гепатита С. Генетическое разнообразие ВГС имеет важное значение для
персистенции вируса, патогенеза, иммунных реакций, передачи инфекции и разработки
успешных вакцин и противовирусных стратегий.
Вирус гепатита С(HCV) относится к семейству Flaviviridae, его единственными
известными хозяевами являются люди и шимпанзе. Вирусные частицы содержат ядро
(капсид), инкапсулированное вирусной оболочкой с ассоциированными Е1 и Е2
гликопротеинами. Геном вируса представлен одноцепочечной РНК.
Существует 7 основных генотипов HCV, которые далее классифицируются на несколько
подтипов. РНК вируса гепатита С часто приобретает мутации, которые позволяют вирусу
избежать иммунного ответа, что способствует разнообразию и эволюции его генома.
Путь передачи вируса гепатита С осуществляется через кровь (переливание компонентов
крови, инъекции шприцами, инструменты для татуирования, незащищенный половой
контакт, донорские органы). Есть риск заражение ребенка от инфицированных
беременных женщин гепатитом С.
Если инфекция вируса гепатита С не разрешается спонтанно, она переходит в
хроническое течение, что сопровождается хроническим заболеванием печени.
Хронический гепатит С, как правило, является медленно прогрессирующим заболеванием,
характеризующимся стойким воспалением печени и приводящим к развитию фиброза
печени и цирроза примерно у 10-20% инфицированных лиц в течение 20-30 лет инфекции
HCV.
У некоторых людей цирроз остается вялым в течение многих лет, в то время как у других
наблюдается прогрессирование гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК), печеночная
декомпенсация и смерть.

Различные генотипы HCV, названные от 1 до 8 в порядке их открытия, отличаются друг
от друга на 30-35% их нуклеотидной последовательности. Эти генотипы далее делятся на
подтипы, определяемые буквами (1a, 1b, 2a, 2b, 3a и др.), Которые отличаются друг от
друга на 20-25% их нуклеотидной последовательности. Изоляты одного и того же подтипа
могут отличаться на 10%.
Распространенность и распределение различных генотипов и подтипов варьируются в
зависимости от географического района. Генотип 1 является наиболее распространенным
во всем мире, причем подтип 1а более распространен в Соединенных Штатах и Канаде, а
подтип 1b более распространен в Европе.
Генотип 2 преобладает в Западной Африке, в то время как генотип 3 является эндемичным
для Юго-Восточной Азии. Генотип 4 в основном встречается на Ближнем Востоке, в
Египте и Центральной Африке. Генотип 5 встречается почти исключительно в Южной
Африке, в то время как генотип 6 преимущественно распространен по всей Азии.
Во всем мире наиболее распространенными генотипами являются 1 и 3, соответственно
составляющие 44% и 25% инфекций ВГС. В России наиболее часто встречаются 1, 2, 3 и 4
генотипы. Генотип 1 хуже поддается лечению, чем 2 и 3. Генотип 2 и 3 лучше поддаются
лечению, в 80% случаев, терапия занимает около 24 недель.
Хотя различные генотипы и подтипы имеют общие основные биологические и патогенные
характеристики, они различаются по своей эпидемиологии и ответам на лечение. Точное
определение генотипа важно для прогнозирования заболевания и более точного подхода к
терапии вирусного гепатита С.